Muligheden for og størrelsen af godtgørelse af energiafgift eller CO2-afgift afhænger af, til hvilket formål virksomheden har anvendt de indkøbte energiprodukter. Der gælder således forskellige godtgørelsesregler alt efter om elektricitet og/eller brændsel anvendes til processer, mineralogiske processer mv. eller kvoteomfattede processer.
I SKM2006.211.SKAT blev det også præciseret, at det ikke er muligt ved aftale at allokere fjernvarme med høj afgiftsbelastning til kunder, der kan opnå godtgørelse af afgiften, og varme med lavere eller ingen afgiftsbelastning til kunder, der ikke kan opnå afgiftsgodtgørelse, når de to former for varme fysisk er blandet sammen.
Se også om de forskellige energiprodukter og procesformål og afgrænsningen mellem disse i afsnit